Se déroulant avant Mobile Suit Zeta Gundam, l'histoire suit l'équipe de test des Titans, Black Otter Team, dans sa mission de tester de nouvelles combinaisons mobiles pour les Titans. Cela commence avec Eliard Hunter, un pilote de combinaison mobile de la Fédération de la Terre affecté aux Titans et transféré à Assouan, un transporteur de classe d'Alexandrie. Là, il rencontre Carl Matsubara, une autre nouvelle recrue des Titans, Audrey April, un pilote qualifié et chef des opérations de test et de collecte de données, et Wes Murphy, un vétéran de la guerre d'un an et du conflit Delaz. L'équipe Black Otter ne se contente pas d'effectuer des tests, elle participe également à de véritables missions de combat contre Zeon Remnants et plus tard, contre AEUG.
