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Un remake et une réinvention de la série originale de Hara Tetsuo (Hokuto no Ken, Hana no Keiji) qui s'est déroulée de 1988 à 1989, avec un nouvel art de Yoshihara Motoki. Cyber Blue: The Lost Children suit l'histoire de Blue, un descendant de colons de Terra qui ont colonisé le monde lointain de Tinos au 22e siècle. L'environnement brutal de Tinos oblige l'humanité à s'appuyer sur un système de survie artificiel implanté dans la poitrine appelé Biomatrix, pour survivre.
Au 25ème siècle, Tinos est dirigée par un gouvernement planétaire déterminé à éradiquer The Lost, des dissidents qui refusent de se soumettre à son régime autocratique et sont pourchassés par ses militaires pour extermination. En contrôlant totalement la production de Biomatrix et en ne les délivrant qu'à ceux qui se soumettent à son autorité, le gouvernement planétaire applique sa volonté dans le but de tuer définitivement les Lost et leurs descendants, les Lost Children.
Situé dans la dystopie de Junk City, Blue rencontre les graisses, une puissante intelligence artificielle robotique, et l'histoire de leur rencontre changera à la fois l'homme et la machine, le sort des enfants perdus et le cours de l'évolution humaine pour toujours.
