Une énorme anomalie a ravagé le continent japonais et ruiné la majeure partie de Tokyo, plongeant les trois quarts de la ville dans l'océan.
Dix ans plus tard, le récit passe à Ganta Igarashi, un élève apparemment moyen fréquentant le collège de la préfecture de Nagano. En tant qu'évadé, survivant du tremblement de terre fantastique, Ganta a mené une vie régulière et n'a aucun souvenir de la catastrophe. Tout cela change lorsqu'un homme étrange couvert d'armure de rubis et de sang flotte à travers les fenêtres de sa salle de classe. Souriant follement, le 'Red Man' massacre toute la classe de Ganta mais plutôt en le tuant, enfonce un éclat de cristal rougeâtre dans le torse de Ganta. Quelques jours après le massacre, Ganta est condamné à mort à Deadman Wonderland, une prison qui sert également de parc à thème et est soumise à une salle d'audience de kangourou en tant qu'accusé.
En arrivant en prison, Ganta est équipé d'une appréhension unique qui suit les indicateurs importants et sa place. Une toxine mortelle est continuellement injectée dans sa circulation sanguine par le grappin, mais néanmoins, elle peut être neutralisée par un médicament sucré particulier toutes les trois fois, qui est souvent administré par diverses actions en prison, c'est-à-dire en se produisant pour la foule , opérer dans les coulisses, acheter avec des facteurs falsifiés (un type d'argent parmi les prisonniers de Deadman Wonderland), etc. Pour rassembler des Cast Points, un délinquant doit exécuter les jeux mortels de l'établissement et vivre. Heureusement pour Ganta, une mystérieuse femme nommée Shiro, qui comprend apparemment Ganta, et est comprise par d'autres prisonniers en même temps lui vient en aide.
Tout en voulant vivre comme un délinquant dans le couloir de la mort, Ganta veut localiser le «Red Man» pour effacer son titre. Dans un tour étrange, Ganta commence à acquérir la capacité de contrôler son sang, d'en faire une arme à l'idée. Inconnu de Ganta, il est devenu l'un des «Deadmen» de la prison, un nombre isolé de prisonniers ont les Branches du Péché qui les rendent capables de contrôler leur sang. Ganta est fait pour participer à des matchs de mort de gladiateurs cruels appelés Carnival Corpse, dont les téléspectateurs anonymes paient des sommes substantielles d'argent pour observer une fois que son talent est trouvé. Au cours de sa longue bataille pour vivre, il parvient à se lier d'amitié avec quelques-uns de ceux qu'il a combattus dans le stade et avec leur aide, Ganta poursuit sa recherche pour découvrir l'identification de `` l'homme rouge '', pourquoi il est devenu un homme mort, ainsi que les secrets obscurs que les autorités pénitentiaires dissimulent
