Negi Springfield, un magicien de 10 ans, aspire à devenir un «Magister Magi», un magicien particulier qui, sous prétexte de fonctionner sous une ONG, utilise ses pouvoirs pour aider des individus ordinaires. Après avoir été diplômé de la Merdiana Magic Academy au Pays de Galles, il pourrait se voir déléguer la tâche d'enseigner l'anglais au collège, où son cours principal comprend 31 filles, chacune assez particulière à sa manière de Mahora Academy. Le spectacle détaille ses expériences et son séjour au Japon alors qu'il les aide dans leurs problèmes, obtient l'approbation et le respect de ses élèves et affronte des dangers magiques de l'intérieur comme de l'extérieur de la Mahora Academy. La relation principale de Negi est avec Asuna Kagurazaka, colocataire et son élève, qui ne l'aime pas au début mais qui le reconnaît ensuite comme un ami et devient sa compagne bien que toutes les femmes aient leur propre histoire et caractère. Il est également à la recherche de son père qui s'appelle le Mille Maître.
Tout en semblant initialement être une autre œuvre de comédie romantique mettant en vedette de nombreux personnages de bish? Jo comme Love Hina, la série est devenue un mélange de romance sh? Nen, de fantaisie, d'horreur, d'action et de comédie. Akamatsu a dit qu'il voulait particulièrement faire quelque chose de «différent» de Love Hina. Negi lui-même est prépubère, et plusieurs de ses scènes avec Asuna sont des variations uniques de la tendance «scène romantique maladroite» du manga harem, immédiatement désamorcé et juste joué pour rire. De plus, beaucoup de filles ne sont pas incapables de le flatter dans un sens enfantin sans attentes intimes chez le lecteur [étude qui est unique?]
En maintenant cette mode particulière, Negi lui-même est considéré comme un autre acteur masculin typique du manga ainsi qu'une comparaison avec Keitaro Urashima de Love Hina. Il est travailleur, compétent et traité avec gentillesse, mais en raison de son apparence et de son âge (bien en deçà de la majorité de ses élèves), il se sent totalement non menaçant et a du mal à être pris au sérieux en tant qu'enseignant; plusieurs de ses élèves le traitent comme un petit enfant rusé, sinon un compagnon de jeu (ou un jouet)
