À Tokyo, reconnu comme Shinto Teito en 2020, Minato Sahashi, 19 ans, est très intelligent, mais en raison de son incapacité à faire face à la pression, il a échoué deux fois au test d'entrée au collège.
Minato rencontre une fille nommée Musubi, qui tombe un jour dans le ciel. Minato apprend bientôt qu'elle est une "Sekirei" qui l'a choisi comme "Ashikabi", parmi le groupe cryptique d'individus qui possèdent la caractéristique héritée qui est capable de créer un accord - en s'embrassant - avec le Sekirei. Cela leur permet d'utiliser leur pouvoir total dans les conflits d'élimination avec d'autres Sekirei et lie le Sekirei à lui. Composé de 108 filles adorables, de femmes plantureuses et de bish? Nen, le Sekirei se bat dans un concours appelé «Plan Sekirei» formé par Hiroto Minaka, le président et fondateur de la mystérieuse et puissante MBI Corporation.
Minato apprend rapidement qu'être l'époux d'une femme n'est pas seulement amusant et amusant, en particulier lorsqu'il est choisi par plusieurs autres Sekirei, chacun formant en outre un accord avec lui, comme leur Ashikabi. Maintenant, Minato devrait découvrir une méthode pour survivre aux conflits mortels du plan Sekirei et à la concurrence intense de ses compagnons pour lui.
Les Sekirei sont des êtres super-puissants utilisant un autre code comme celui d'une personne. Le vaisseau spatial Sekirei s'est écrasé sur Terre en 1999 sur l'île de Kamikura et a été découvert par deux élèves, Hiroto Minaka (président potentiel de MBI) et Takami Sahashi (chercheur en chef potentiel de MBI et maman de Minato). À bord, le couple avait découvert 108 formes de vie, expliquées comme «un pilier et 107 oisillons».
